標(biāo)題：我國創(chuàng)新基因大模型SYMPLEX引領(lǐng)全球，開啟基因挖掘新時(shí)代
隨著生物技術(shù)的飛速發(fā)展，全球天然基因庫已經(jīng)積累了數(shù)十億量級的序列，蘊(yùn)藏著海量高價(jià)值功能基因。然而，當(dāng)前僅有少數(shù)明星基因被深度挖掘，絕大多數(shù)仍處于“沉睡”狀態(tài)。在這個基因挖掘的藍(lán)海市場中，我國科研團(tuán)隊(duì)的創(chuàng)新基因大模型SYMPLEX正在引領(lǐng)全球，開啟基因挖掘新時(shí)代。
SYMPLEX是一種面向合成生物學(xué)元件挖掘與生物制造應(yīng)用的大語言模型，通過融合領(lǐng)域大語言模型訓(xùn)練、合成生物專家知識對齊和大規(guī)模生物信息分析，實(shí)現(xiàn)了從海量文獻(xiàn)中自動化挖掘功能基因元件，并精準(zhǔn)評估其工程化應(yīng)用潛力。這一創(chuàng)新性的研究成果，不僅展示了大語言模型賦能生物制造的巨大潛力，也揭示了基因挖掘的新方向。
SYMPLEX在mRNA疫苗生物制造關(guān)鍵酶——加帽酶的挖掘中取得了顯著成果。第三方公司實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證顯示，其獲得的酶在催化效率上超越了國際頭部企業(yè)New England Biolabs（NEB）商業(yè)化加帽酶2倍以上，顯著提升了mRNA疫苗生產(chǎn)率和成本效益。這一突破性的成果不僅為生物制造領(lǐng)域提供了高性能新型加帽酶，也為我國在生物技術(shù)領(lǐng)域的國際競爭力增添了砝碼。
SYMPLEX的成功研發(fā)離不開其獨(dú)特的研發(fā)思路和強(qiáng)大的技術(shù)實(shí)力。它將大型語言模型（LLM）與結(jié)構(gòu)化生物知識庫深度融合，開發(fā)出SYMPLEX智能基因挖掘平臺。這一平臺通過自動化閱讀和理解千萬級體量的生物學(xué)文獻(xiàn)，在基因、功能和知識水平上提取分析文獻(xiàn)內(nèi)容，并與專家數(shù)據(jù)庫進(jìn)行概念對齊、交互和基于先進(jìn)生物信息技術(shù)的統(tǒng)計(jì)模式生成，提供證據(jù)鏈完整的高質(zhì)量候選基因集合。此外，平臺還具有自動生成基因功能相關(guān)的細(xì)粒度知識樹的功能，為科學(xué)家探索廣泛的生物機(jī)制和分子過程提供了強(qiáng)大的工具。
目前，SYMPLEX在線交互式平臺已上線供研究人員免費(fèi)使用。該平臺采用模塊化設(shè)計(jì)，提供了三個核心功能：文獻(xiàn)智能提取引擎PubEngine，支持高通量的文獻(xiàn)智能檢索分析與可視化交互；基因功能標(biāo)注系統(tǒng)GeneTagger，實(shí)現(xiàn)從分子機(jī)制到生物過程的細(xì)粒度自動化基因與功能提??；標(biāo)準(zhǔn)化知識中樞GeneNorm，實(shí)現(xiàn)與專家知識庫的概念對齊與標(biāo)準(zhǔn)化，支持知識樹構(gòu)建和功能模式識別。這些功能為全球科研人員提供了一個高效、便捷的基因挖掘工具，有助于推動基因科學(xué)的發(fā)展。
值得一提的是，SYMPLEX的成功研發(fā)和應(yīng)用不僅對我國科研事業(yè)的發(fā)展起到了推動作用，也對全球生物技術(shù)領(lǐng)域產(chǎn)生了深遠(yuǎn)影響。它展示了我國在基因科學(xué)領(lǐng)域的創(chuàng)新能力和科研實(shí)力，也為全球科研人員提供了一個新的研究方向和思路。
總的來說，我國創(chuàng)新基因大模型SYMPLEX引領(lǐng)全球，開啟基因挖掘新時(shí)代。這一成果不僅為我國在生物技術(shù)領(lǐng)域的國際競爭力增添了砝碼，也為全球科研人員提供了一個高效、便捷的基因挖掘工具，有助于推動基因科學(xué)的發(fā)展。我們期待著SYMPLEX在未來能夠取得更多的突破性成果，為人類對生命的探索和認(rèn)知做出更大的貢獻(xiàn)。
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